遺伝子実験棟 機器リスト

管理番号
28
機器名
次世代シーケンサー
メーカー
イルミナ
モデル番号
GAIIx
機器区分
施設
設置場所
4階微生物培養室1
利用者区分
学内

概要

特徴

 イルミナのケミストリーは、シングルリードとペアエンドライブラリーをサポートする。ペアエンド法で高解像度のゲノムシーケンスを実施できるだけではなく、長鎖インサートのメイトペア法を用いれば、効率よくシーケンスアセンブル、de novoシーケンス、大規模な構造変異の検出が行える次世代シーケンサープラットフォームである。ペアエンドとメイトペアを組み合わせることにより、あらゆるゲノムをの特徴付けが可能となる。この多彩なサンプル調製法により、全ゲノムやターゲットリシーケンス、トランスクプトーム解析、Small RNAの同定、DNAメチル化プロファイリング、全ゲノム網羅的な核酸タンパク質の相互作用解析など、幅広いアプリケーションに対応可能である。

仕様

 ラン時間と出力データ

リード長

シングルフローセルラン時間

 データ量
1×35 bp 〜2日間 10‐12 Gb
2×50 bp 〜5日間 25‐30 Gb
2×75 bp  〜7日間 37.5‐45 Gb 
2×100 bp  〜9.5日間 54-60 Gb
2×150 bp 〜14日間 85-95 Gb

クオリティー値

リード長

Q30以上の塩基割合

2×50 bp

> 85%

2×100 bp

> 80%

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